На узком Греческом полуострове с сильно расчлененной поверхностью не могли образоваться большие речные системы. Преобладают горные реки, короткие, с крутым падением.

Текут реки к морю в узких, часто каньонообразных долинах. Самая длинная река Греции, протянувшаяся почти на 300 км и целиком находящаяся в пределах страны – Альякмон (Вистрица). Наиболее крупные многоводные реки – Морица (Эброс), Нестос (Место), Стримон (Струма) и Вардар – берут начало в центральной, массивной части Балканского полуострова и протекают по территории Греции только на участках своего нижнего течения. Все они орошают северную часть страны. Самая больная река Западной Греции – Ахелоос, богатейшая по запасам гидроэнергоресурсов. Фессалийскую равнину орошает река Тньос. Наиболее многоводная и длинная река полуострова Пелопоннес – Алфеос. Питание рек преимущественно дождевое и снегово-дождевое. Характерно резкое сезонное колебание стока. Дождливой зимой и весной, когда тает снег в горах, реки многоводны и бурны: они вздуваются после каждого ливня. Летом они сильно мелеют, некоторые даже полностью пересыхают. Более влажная западная половина Греции имеет больше постоянных рек, чем восточная, обладает более густой речной сетью.

Реки Греции не пригодны для судоходства, но играют довольно большую роль, как источники энергии. Еще большее хозяйственное значение они имеют для орошения полей в засушливый период.

В Греции насчитывается свыше 20 озер, площадью от 10 до 100 кв. километров. К самым крупным и глубоким из них относятся озера Трихонис (95,5 км2) – на западе, Волви (75,6 км2) и Вегоритис (72,5 км2) – на севере. Одно из крупнейших озер Балканского полуострова – Преспа (283 км2), лишь незначительной частью входит в пределы Греции. В основном оно расположено на территории Югославии и отчасти заходит и в Албанию.

Много в Греции карстовых озер. Они, как правило, небольшие, питаются, в основном, подземными водами. Крупнейшее из них Янина (22 км2) на северо-западе страны.